La duración es de cuatro (4) semestres académicos equivalente a 2 años de formación profesional.
Se tiene en cuenta tanto el perfil del ingresante como del egresado. Es así que el programa de la maestría en Ciencias e Ingeniería con Mención en Desarrollo Agrario y Sostenible está dirigida a bachilleres y profesionales de los campos de Agronomía, Industrias alimentarias e Ingeniería Ambiental y otros.
| Plan de Estudios | Créditos | Pre-Requisitos |
| Ciclo I | ||
| Sociología Rural | 4 | |
| Metodología de Investigación | 4 | |
| Agroecología | 4 | |
| Análisis de Sistemas Agropecuarios | 4 | |
| Ciclo II | ||
| Biodiversidad Biológica y Cultural | 3 | |
| Manejo Sostenible de Cuencas | 3 | |
| Métodos Avanzados de Procesamiento de datos | 4 | |
| Tesis I (Elaboración y Sustentación del Proyecto de tesis) | 6 | Metodología de la Investigación |
| Ciclo III | ||
| Planificación y Evaluación de Sistemas Sustentables | 4 | |
| Biotecnología y Desarrollo Sostenible | 3 | |
| Manejo Ecológico e Integrado de Plagas y Enfermedades | 4 | |
| Tesis II(Ejecución de la Tesis) | 6 | Tesis I |
| Ciclo IV | ||
| Redacción de Artículos Científicos y Seminario en Docencia | 3 | |
| Tesis III (Sustentación del Informe Final) | 6 | Tesis II |
| Innovación Cambio y Desarrollo | 3 | |
| Electivos) | 3 | |
| Total de Créditos | 64 | |
| Cursos Electivos | Creditos |
| Ciclo IV | |
| Globalización y política Agraria | 3 |
| Manejo Sostenible de Semillas | 3 |